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张笑天教授做客干细胞中心作学术讲座(2018-11-15)

       20181112日,浙江大学干细胞与再生医学中心钱鹏旭研究员邀请到来自美国温安洛研究所表观遗传学研究中心Gerd Pfeifer实验室的张笑天博士进行了题为“3D genome interaction of DNA methylation Canyons in normal and malignant hematopoiesis”的学术报告。
  张笑天博士于2016年获得美国贝勒医学分子人类遗传性博士2016-2017年在贝勒医学从事博士后研究工作,2017-至今作为助理研究员在文安研究所建立了自己的科研团队。张博士一直专注于探索DNA甲基化与染色质高级结构在正常血液发生和白血病发生中的作用。
  高级染色质结构和DNA甲基化参与了多种发育过程,但是目前仍不清楚它们之间的相互作用会对细胞命运产生怎样的影响。张笑天博士首先介绍了近些年来研究染色质高级结构的热门技术Hi-C,他和他的团队正是通过Hi-C数据结合DNA甲基化数据发现一类被命名为canyon”的大的DNA低甲基化区域(约10kb),它们之间可以跨越几Mb或者不同染色体,形成极长的环状结构。在人类基因组中包含了大约3.5Mb这样的低甲基化的互作区域。数据显示这些环的形成更倾向于“相分离”的原理形成一个基因组亚结构,而并不依赖于CTCF。有趣的是,这种基因组亚结构只出现在特定类型的细胞中,比如干、祖细胞。另外,他们还发现了一个特殊的DNA低甲基化区域,它与HOXA基因群存在互作,敲除该区域会导致互作消失,而且会促进造血干细胞向下游分化。
  报告结束后,张笑天博士与在座的老师同学进行了更加深入的交流。张博士进一步对HOXA的调控方式进行了说明,他提到HOXB基因簇虽然与HOXA存在一定同源性且在造血干细胞分化中也起到了重要的调控作用,但是并没有发现HOXB基因簇存在这样的远距离调控模式,这可能是生物进化出的一种特异性调控HOXA基因簇的方式。另外也有老师提出将该调控HOXA的区域克隆至基因组其他位置观察是否仍能相互作用,张博士回答这是一个很好的想法但是该区域太大,以目前的技术还很难实现。
  这次精彩的学术报告,让我们了解到了一类新的DNA甲基化调控染色质高级结构的方式,后续的热烈讨论也给了我们很多思想上的启发。最后我们再次感谢张博士给我们带来的这次精彩的学术讲座。
 
编辑姜蓬垒

 

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